TP SVT Mettre en évidence la spécificité enzyme-substrat

Comment un plant de pomme de terre fait-il pour fabriquer une pomme de terre (on dit un tubercule) ?

Nous savons qu’une enzyme comme l’amylase fait l’hydrolyse de l’amidon à une vitesse incroyablement élevée :

Nous cherchons maintenant à comprendre ce qui rend l’enzyme aussi rapide.

Émettre une hypothèse

« On émet l’hypothèse que l’enzyme reconnait son substrat et pas un autre, un peu comme une clé reconnait une serrure.« 

Pour tester cette hypothèse, nous allons nous intéresser au plant de pomme de Terre. Chaque plant possède des tubercules souterrains (=la pomme de terre), dans lesquels sont stockés de l’amidon sous forme de grains appelés amyloplaste (voir ci-dessous: coloration à l’eau iodée)

L’amidon est une très longue molécule. Elle est formée par l’assemblage de petites molécules de glucose que la feuille fait grâce à la photosynthèse.

L’amidon représente donc une réserve énergétique pour la plante. Nous la lui subtilisons en la ramassant et en la mangeant en purée ou en frites.

La synthèse de l’amidon c’est-à-dire l’assemblage des molécules de glucose est assurée par une enzyme: l‘amidon synthase

Elle est présente dans le tubercule, et on va l’extraire.

Réaction catalysée par l’amidon synthase des cellules du tubercule :

Pour réaliser cette réaction, nous allons fournir à l’amidon synthase deux types de substrat:

  • le glucose
  • le glucose 1-Phosphate

Ces deux molécules ne diffèrent l’une de l’autre que par un groupement phosphate.

Prévoir un résultat

On prévoit que la réaction n’aura pas lieu avec l’un des deux substrats: lequel d’après vous ?

Matériel :

  • 2 béchers
  • 1 scalpel
  • 1 planche à découper
  • De l’eau distillée
  • marteau et pilon
  • Un cristallisoir
  • De la glace pilée
  • Une pomme de terre
  • Un économe
  • 2 entonnoirs
  • Du coton
  • Du papier filtre
  • 9 tubes à essai sur portoir
  • Une solution de glucose
  • Une solution de glucose-1-Phosphate
  • Une plaque à cupules

Méthode pour extraire l’amidon synthase

  • L’extraction se fait à froid = glace pilée
  • Épluchez la patate
  • Pesez 50 g
  • Sur une planche, coupez vos 50g en fines lamelles
  • Dans le mortier, broyer vos morceaux de patate avec 40 ml d’eau distillée
  • Vous obtenez un jus de patate assez liquide contenant enzymes et amyloplastes
  • Filtrez selon le montage suivant
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Méthode pour montrer la spécificité enzyme substrat

Pour tester notre hypothèse, nous disposons soit de glucose soit de glucose-1-P.

Nous supposons que l’enzyme reconnait soit l’un soit l’autre.

Préparez 3 séries de tubes :

  • Série 1: 3 tubes contenant 1 ml d’eau distillée (numérotés 0, 1 et 2)
  • Série 2: 3 tubes contenant 1 ml de glucose-1-P (numérotés 3, 4 et 5)
  • Série 3: 3 tubes contenant 1 ml de glucose (numérotés 6, 7 et 8)

Lancez l’expérience :

  • Série 1 : ajoutez 2 ml de filtrat de Pomme de terre et lancez le chronomètre
  • Introduisez les tubes dans le bain marie à 35°C.
  • Série 2 : ajoutez 2 ml de filtrat de Pomme de terre et lancez le chronomètre
  • Introduisez les tubes dans le bain marie à 35°C.
  • Série 3 : ajoutez 2 ml de filtrat de Pomme de terre et lancez le chronomètre
  • Introduisez les tubes dans le bain marie à 35°C.

Comptez 3 minutes.

Révélez les résultats des réactions chimiques

  • Préparez votre plaque à cupules en numérotant les cupules
  • 1ml de chaque série est prélevé au bout de 3 minutes
  • Déposez ce ml dans une cupule de la plaque à cupules
  • Ajoutez une goutte d’eau iodée
  • Prenez des photos
  • Consignez les résultats dans un tableau

Résultats attendus

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